Table 5 Genetic analysis of Thai CaKoVs compared with reference CaKoVs at putative amino acid cleavage sites
From: First detection and genetic characterization of canine Kobuvirus in domestic dogs in Thailand
Viruses | Year | Country | Amino acid position | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
171/172 | 553/554 | 776/777 | 1054/1055 | 1165/1166 | 1330/1331 | 1665/1666 | 1759/1760 | 1786/1787 | 2176/2177 | |||
CU-53 | 2016 | Thailand | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
CU-101 | 2016 | Thailand | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
CU-249 | 2017 | Thailand | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
CU-716 | 2018 | Thailand | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
12D049 | 2012 | Korea | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
UK003 | 2008 | UK | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
26/BRA | 2016 | Brazil | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
SMCD-59 | 2015 | China | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
CE9 | 2012 | Australia | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
B103 | 2010 | Africa | Q/G | Q/H | Q/T a | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
75 | 2011 | Africa | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
82 | 2010 | Africa | Q/G | Q/H | Q/T a | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
DD2 | 2003 | Africa | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |
US-PC0082 | 2010 | USA | Q/G | Q/H | Q/A | Y/V | Q/G | Q/G | Q/G | Q/A | Q/G | Q/G |