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Table 1 Results (threshold cycle values) of real-time PCR obtained from suspected clinical samples

From: A sheeppox outbreak in Morocco: isolation and identification of virus responsible for the new clinical form of disease

Identification number

Nasal swab

Ocular swab

Rectal swab

Blood

Crusted scab

Lung nodule

 

TaqMan assay

TaqMan assay

TaqMan assay

TaqMan assay

TaqMan assay

TaqMan assay

 

(Ct value)

(Ct value)

(Ct value)

(Ct value)

(Ct value)

(Ct value)

1 (outbreak n° 1)

25,93

25,97

30,83

36,2

19,88

-

2 (outbreak n° 1)

27,57

27,8

32,77

38

22,88

-

3 (outbreak n° 1)

29,12

31,08

28,32

37,6

-

-

4 (outbreak n° 1)

30,28

30,83

40,03

30,75

-

-

5 (outbreak n° 1)

31,97

32,8

35

39,87

19,59

-

6 (outbreak n° 1)

38,33

26,07

38,93

37,78

-

-

7 (outbreak n° 1)

25,82

39,75

33,6

33,42

-

-

8 (outbreak n° 1)

No Ct

42,5

No Ct

-

-

18,7

9 (outbreak n° 1)

39,93

No Ct

39,21

37,1

-

-

10 (outbreak n° 1)

38,3

22,97

30,32

37,8

-

-

11 (outbreak n° 1)

24,03

24,5

37,17

40,93

20,98

-

12 (outbreak n° 1)

21,56

35,95

No Ct

-

-

17,95

13 (outbreak n° 2)

35,07

33,25

38,78

41,1

-

-

14 (outbreak n° 2)

29,8

28,83

No Ct

36,5

-

-

15 (outbreak n° 2)

30,69

34,64

42,5

30,29

-

-

16 (outbreak n° 3)

36,64

31,21

35,6

No Ct

-

-

17 (outbreak n° 3)

34

29,86

36,04

No Ct

-

-

18 (outbreak n° 3)

29,7

33,5

38,75

-

-

19,93

19 (outbreak n° 3)

34,2

33,93

34,93

40,75

-

-

20 (outbreak n° 3)

33,92

36,33

38,2

36,4

-

 

21 (outbreak n° 4)

35,07

37,9

39,5

33,96

-

 

22 (outbreak n° 4)

40,48

40,16

41,1

-

-

20,37

23 (outbreak n° 4)

41,7

35,87

35,1

No Ct

-

-

24 (outbreak n° 4)

40,16

35,83

34,83

38,04

-

-

25 (outbreak n° 4)

35,66

33,3

39,5

35,86

-

-

26 (outbreak n° 5)

No Ct

33,95

35,32

No Ct

-

-

27 (outbreak n° 5)

37,5

31,39

40,3

40,68

-

-

28 (outbreak n° 5)

33,96

30,42

39,5

-

-

22,94

29 (outbreak n° 6)

27,5

27,5

38

No Ct

-

-

30 (outbreak n° 6)

40

27,18

39,5

40,67

-

-

31 (outbreak n° 6)

24,58

22,28

38

No Ct

-

-

32 (outbreak n° 6)

19,39

26,8

29,89

39,48

-

-

33 (outbreak n° 7)

28,79

22

26,62

33,84

-

-

  1. -° : sampling unrealized.
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BMC Veterinary Research

ISSN: 1746-6148

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