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Table 1 Canine RT-PCR primer sets for selected tyrosine kinase receptors and signaling node kinases

From: Canine pulmonary adenocarcinoma tyrosine kinase receptor expression and phosphorylation

Canine-specific primers used for EGFR PCR amplification of the exon gDNA

 

       Forward

       Reverse

Exon 18

5′-TGAGCATTGCGGCAGTTGCT-3′

5′-ACACCCGGAAGTCATGGAAC-3′

Exon 19

5′-GAGTGCACAGCTCTGCTCAAG-3′

5′-GCTATCCGGGCCTGTGGACAAG-3′

Exon 20

5′-CTCTGAAGCTTTCCTCTCCCC-3′

5′-GCGAAGTACCTGCCCTACTTT-3′

Exon 21

5′-GGCATGAACTACCTGGAAGACCG-3′

5′-CTGTGATCTTGACGTGCTGCG-3′

Primers used for RT-PCR

Primer set

       Forward

       Reverse

AKT

5′-TGCTTAAGAAGGACCCCAAGC-3′

5′-GCTGGTCCAGTTCGAGGGA-3′

ALK

5′-CTGTATCGGGGTGAGTCTGC-3′

5′-CAGGGCCTGGACAGGTTAAG-3′

c-KIT

5′-GATGGCCCCTGAGAGCATTT-3′

5′-GCCTTTTCAGGGGATCAGCA-3′

EGFR

5′-TGGTCCTGGGGAATTTGGAA-3′

5′-GGTTATTGCTGAAGCGCACA-3′

ErbB2/HER2

5′-CCCGAGACCCACCTGGATA-3′

5′-CAGGGCGTAGTTGTCCTCAA-3′

ErbB3/HER3

5′-CGAGGAGGTGTCTGTGTGAC-3′

5′-CTTGTAGATGGGGCCCTTGG-3′

FGFR1

5′-TTTTCAGCCTTGAAAGCACCATAA-3′

5′-CAGCTGAATGTGCTGGTCGC-3′

FGFR4

5′-CTACCTCCTGGGCATCAAGC-3′

5′-GAACTTGCACTCCTCGGTGA-3′

FLK-1/VEGFR2

5′-CTAGGTAAGCCTCTTGGCCG-3′

5′-ACAATCACCATGAGTGGCCC-3′

GAPDH

5′-GCCTGGAGAAAGCTGCCA-3′

5′-AGGTGGAAGAGTGGGTGTCA-3′

MAPK

5′-AGGCTGTTCCCAAATGCTGA-3′

5′-CCTTGGGCAGGTCATCTAGC-3′

PDGFRα

5′-TGATTGAGAGGCTGGCACAC-3′

5′-AATGACCGTCCTGGTCTTGC-3′

PDGFRβ

5′-GGCCCGTTCAGGTGAGAAAA-3′

5′-GAGTTTGGGGTGTCTTGGCT-3′

RET

5′-AGCAGGATACACGACCGTTG-3′

5′-GTCCCGATGGACAAGCTTCA-3′

ROS-1

5′-CTGTGAGAGCCAGTTCACCC-3′

5′-ACATCACCTTTCACGTCGCT-3′

RPS6

5′-GCTAAGCGGAAGTCGGGTC-3′

5′-TGGGGAAGCCTTGTTTGTCA-3′